该院麻醉科成立于1952年，是临床二级学科，麻醉学硕士、博士学位授予单位，为第二军医大学麻醉学中心。科室目前已形成了麻醉学教研室、临床麻醉、麻醉诱导室、麻醉恢复室、ICU、疼痛诊疗、麻醉学实验室、第一手术室、第二手术室、第三（胸心外科）手术室、DSA手术室等亚科齐全的综合布局。科室现有医生53名，平均年龄35岁，其中正高职称4名，副高职称4名，中级职称20名，绝大多数人员获得医学硕士或医学博士学位；手术室与ICU护理人员约80名。临床麻醉有手术室38间，住院病人年手术麻醉量1.6万余例（其中全麻占70%以上），连续四年均列上海市首位，其中各种心脏与大血管手术麻醉1 000余例。ICU每年收治全院各类危重病人800余例。在心脏与血管麻醉、大血管与脑血管介入治疗麻醉、神经外科麻醉、烧伤麻醉、危重病与老年病人麻醉以及危重病人围手术期监测与治疗、围手术期镇痛和癌性疼痛与慢性疼痛的诊断治疗等方面形成了自己的特色。科室装备有国内领先的仪器设备，包括Drager、Datex-Ohmeda等麻醉机与呼吸机45台、菲利蒲多功能监护仪60台，并配有持续心排出量监测仪（CCO）、BIS、血气分析仪、血液电解质分析仪、脑氧饱和度监测仪、肌松监测仪、纤维支气管镜、超激光疼痛治疗仪等特殊监测与治疗仪器设备。目前承担麻醉学专业博士、硕士、学士和进修医师以及各种医学专业的麻醉学教学工作。科室已形成了心血管麻醉和急性肺损伤与急性呼吸窘迫综合征两大临床与实验研究的稳定发展方向。近五年来出版主编或副主编专著9部，参加编写有关麻醉学与外科学专著30余部，年均公开发表论文、论著20余篇。科室与德国、美国、加拿大等国家建立了较广泛的国际间交流与合作。常年坚持邀请国外学者来院讲学，每年派送1～2名优秀医生前往国外著名医院留学、进修专科麻醉。科室发展的总体目标是综合性的围手术期处理科(Department of Perioperative Management)。
