|
Internet是一个应用广泛的国际互联网络,其中蕴藏了极其丰富的生物医学信息,临床医生除可检索MEDLINE文献数据库及医药学数据库外,还可阅读或浏览网上发布的传染病和流行病疫情、医学多媒体数据库、病理生理切片图象、放射影像甚至还可以与其他用户组成医学兴趣小组,共同讨论和交换对某些疾病的诊疗意见。本文仅就网络医学信息检索方面的作一总结,以促进医学工作者更好地利用和开发网络资源。
第一章 医学网址的相关信息
使用医学专业网址与使用其他类别的网址从本质上说是一致的,但医学专业网址又有与其他专业网址不一样的地方,在它的长期使用过程中,形成了自己的网址专业语言。
最高级域
掌握网址的关键在于理解Internet网编址的体系。理解网址的方法是从右向左阅读。最高级域所代表的范围最广,它一般是表示地区和机构类型的范畴和属性。一般有两种方法表示最高级域。1,地区域:如cn代表中国;tw代表中国台湾;ca代表加拿大。2,机构域:如com代表商业性机构;edu代表教育性机构;gov代表政府性机构;int代表国际性机构;net代表网络机构;org代表非盈利性机构等。
如北京医科大学的网址:http:\\www.bjmu.edu.cn/
在该例子中,最高级地区域是cn,告诉我们该计算机服务器在中国;最高级机构域是edu,又告诉我们该网站属于教育机构。
域名和子域
在上一个例子中,当我们读完最高级域,继续向左边读时,子域就使该网站更专业化,如上例中的bjmu这个英文缩写告诉我们该机构是北京医科大学;最左边的www,告诉我们这是全球信息网。
了解医学信息资源还要掌握医学网络缩写术语,这样会有助于正确选择网址。如med代表医学;medline代表医学在线;medinfo代表医学信息;psych代表心理学;docdir代表医生指南;telemed代表远程医学;pharminfo代表药学信息等等。
第二章 网络医学文献的检索
1.1 MEDLINE文献数据库的检索
MEDLINE数据库是美国国立图书馆MEDLARS系统中规模最大、权威性最高的著名医学文献数据库。它建立于70年代初,收录了1966年至今的世界70多个国家出版的生物医学期刊约3,600种,另外于1976年~1981年还收录了图书专著。MEDLINE数据库实际上是由《INDEX
MEDICUS》(《美国医学索引》)、《INTERNATIONAL NURSING INDEX MEDICUS》(《国际护理学索引》)、及《INDEX
TO DENTAL LITERATURE》(《牙科文献索引》)三种重要的医学索引组成。内容涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、牙科学、护理学、生物学、兽医学、物理学、社会科学、心理学、神经精神病学及解剖、动植物、微生物学等多学科领域。
MEDLINE数据库提供多种方式的检索服务,如光盘、远程登录及在WWW上的检索。由于前两种方法要求用户必须具备一定的物质和技术条件,如要具备MEDLINE的光盘或具备与MEDLINE数据库联机等条件,其次还要求用户必须具备一定的计算机知识,并对检索系统比较熟悉。但是随着全球信息化进程的加速、INTENET的普及,特别是图形界面信息服务方式…WWW的出现,用户可以不经过培训、不需要付费就可以自由检索MEDLINE数据库了。
我们可以通过多种途径访问MEDLINE数据库,如:
1, 通过健康通道(Healthgate)主页:http:\\www.healthgate.com
2, 通过美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information
NCBI )主页:http:\\www.ncbi.nlm.nih.gov
这里我们以通过健康通道(Healthgate)主页访问MEDLINE数据库为例,介绍其检索方法:任何一种途径都提供了普通检索和高级检索两种界面对MEDLINE数据库进行检索。
普通检索界面:
启动Web 浏览器后,键入相应的WWW地址:
http:\\www.healthgate.com/medline/search-medline.shtml
用户就可以见到如下的普通检索界面:
 |
使用这个界面检索MEDLINE是一件非常容易的事情,你只要在检索窗口键入一个关键词,一个自由词、一个主题词、一个作者名、一个基因符号、一个时间、一个词组或一个自由词与布尔逻辑运算符所组成的检索式,也就是在检索窗口键入一个符合自己检索要求的概念,然后按回车键或文献检索按钮,就可以得到以这个概念为中心的MEDLINE数据库中的医学文献,与联机检索和光盘检索相比,用户不必记忆大量的标识符和检索词的组配方法,就能完成医学文献的检索。
在这个界面上,系统将检索限定在近两年的MEDLINE医学文献范围内,另有三个选择项需要注意,对它们进行设置,可以限定检索,第一项?quot;
Published in English"项,选定它,可以将检索范围限定在英文医学文献范围内;第二项是"Abstract
Available"项,选定它,是要求只检出有文摘的文献;第三项是显示篇数设置项,即设置命中文献的显示篇数,可选范围有5、10、20、30、50、100、200等。
高级检索界面:http:\\www.healthgate.com/medline/adv-medline.shtml
普通检索界面虽然使用方便,但由于只能检索近两年的MEDLINE医学文献,就不能满足某些用户的大范围检索的要求。另外,由于使用的是接受自然语言的检索方法,限定比较少,检准率不是很满意。为了解决这个问题,用户可以使用MEDLINE高级检索界面。
在web浏览器的地址键入MEDLINE服务器高级检索界面的URL地址 http://www.healthgate.com/HealthGate/MEDLINE/search-advanced.shtml,用户就可以见到下面的 MEDLINE高级检索界面。为了显示方便,将这个界面分为三人部分,每一部分是前一部分的继续。
这就是MEDLINE高级检索界面的第一部分,第一个选项就是ReADER(TM)编译器的开关选项,如果选择开,你就可以在它下面的检索窗口键入一个能代表你的检索要求的概念或词,而编译器会自动将你的自由检索词转化为恰当的索引短语、检索命令或特定数据库的特定检索式,帮助你得到所要的医学文献。MEDLINE高级检索面中有多个选择项可以检索要求进一步限定,这一部分主要有三个限定,每种限定又有"ADN"和"OR"逻辑选项,可以与标题、文摘中出现某个词的文献进行逻辑运算,也可以与某个作者的进行逻辑运算。此外,还有一个与普通检索界面相同的选择项,即显示篇数选项。这时,如果用户认为限定比较满意,就可以按回车键或文献检索按钮开始文献的检索,如果还需要更进一步的限定,则应当对第二第三部分的选择项进行设置。
第二部分的选择除了有与普通检索界面相同的出版语言选项外,还可以限定所检医学文献是否与人类相关、检索的时间范围、研究对象的年龄组、期刊子集和医学文献的类型。
高级检索界面的第三部分可以限定检出医学文献的显示格式、是否自动检索键入词的复数形式、是否对检索结果进行排序及排序的标准。限定完成之后,就可以按回车键或文献检索按钮,开始检索文献。
附:MEDLINE检索记录中字段一览表
标识符 字段名称
AAA Abstract(著者文摘)
AB Abstract(文摘)
AD Address(地址)
AU Author(著者)
CA Call Number(索书号)
CM Comment(评论)
CY Country(出版国)
DA Date of Entry(记录输入日期)
DP Date of Publication(出版日期)
EA English Abstract Indicator(英文文摘标识)
EM Entry Month(记录输入月份)
GS Gene Symbol(基因符号)
ID ID Number(登记号)
IP ISSUR/Part/Supplement(期/分辑/补充本)
IS ISSN(国际标准号)
JC Journal Title Code(斯刊代码)
LA Language(语种)
LI Special List Indicator(特种期刊标识)
LR Last Revision Date(记录最后修订日期)
MH MeSH Headings(主题词)
MN MeSH Tree Number(MeSH 树形号)
MR Major Revision Date(记录主要修订日期)
MRI Machine-Readable Identifier(条形码)
NI No-Author Indicator(匿名著者)
NM Name of Substance(物质名称)
NP Not for Publication(非NLM出版物)
PG Pagination(页码)
PS Personal Name as Subject(人名主题)
PT Publication Type(出版类型)
PY Indexing Priority(标引优先级)
RF Number of References(参考文献)
RI Revsion Indicator(修订标识)
RN CAS Registry Number(CAS登记号/EC代码)
RO Record Originator(记录作者标识)
SB Journal Subset(期刊子集)
SH Subheadings(副主题词)
SI Secondary Source ID(第二来源标识)
SO Source(出处)
TA Title Abbreviation(刊名缩写)
TI Title (篇名)
TT Translliterated/Vernacular Title(篇名译文)
UI Unique Identifier(流水号)
VI Volume Issue(卷号)
YR Year(出版年)
ZN MeSH Tree Number(MeSH 地理树形结构号)
1.2专利文献的检索
专利作为一种有久远历史的技术信息源,已越来越被人们重视。目前,专利出版物数量已将近占世界全部科技出版物的1/4,从中获取最新科技信息的使用率已与科技期刊旗鼓相当。美国专利与商标局(U.S
Patent and Trademark Office:http:\\www.uspto.gov/patft/)在Internet上免费提供了美国专利文摘数据库的检索服务,为获取专利信息提供了极大的方便。
美国专利文摘数据库收录了1976年至现在(每月更新数据)的美国专利文献200多万篇,每篇文献的著录项包括专利号、发明人、转让人、题目、文摘、分类、发明人国别、通讯地址等。该数据库检索功能强大,上述这些著录项均可作为检索字段,用户通过键入关键词运用逻辑组配符并选择好检索年度范围,即可方便地实施检索,一般在数秒钟内就可获得检索结果。
检索方法
在美国专利文摘数据库检索主页上同样提供了两种检索方法,即逻辑检索法(boolean)和高级检索法(advanced)。
 |
逻辑检索方法(boolean search)
在逻辑检索界面中主要有关键词输入(term1 和term2)、数库文档选择(select database )、字段选择(field)、逻辑运算符(operator)、返回结果选择(rank
results)等功能框。键入相应地址调出boolean search界面后,可按下列步骤进行检索:
1.选择数据库文档。有两个功能键"all"和"specify"用于选择数据库各文档。"all"按钮用于选择所有数据库文档。选择该功能键后,可检索1976至现在所有年份的数据库文档。"specify"按钮用于按每年份或年段选择数据库文档,可通过select
database功能栏直接选择。各数据库文档中专利收录情况可通过帮助文档中的database status了解。
2.在term 1栏中键入关键词。
3.在field 1栏中选择限定term 1中关键词的字段。
4.在boolean option栏中选择逻辑运算符。
5.在term 2栏中键入关键词。
6.在field 2栏中选择限定term 2中关键词的字段。
7.选择对返回结果的要求。"Chronologically"按钮为按年代排序返回检索结果。"Relevance"按钮为按检出文献与检索要求的关联程度对返回检索结果进行排序。系统默认为按年代排序返回检索结果。
8.击"submit query"按钮进行检索。
如果用一个关键词进行检索,省去4-7步骤。
·逻辑运算符的使用
逻辑检索运算包括and、or、and not、xor,其应用方法、含义及举例如下:
逻辑检索运算符and的使用
在term 1中键入关键词1,在option(逻辑操作栏〕中选择"and"逻辑运算符,在term
2中键入关键词2,逻辑表达式为:关键词1 and 关键词2。逻辑表达式含义:要求检索同时包含关键词1和关键词2的文献。
例如:在term 1中键入关键词interferon,在option(逻辑操作栏〕中选择"and"逻辑运算符,在term
2中键入关键词purification,逻辑表达式为:interferon and purification,即要求检索出有关于扰素纯化方面的专利文献。
逻辑检索运算符or的使用
在term 1中键入关键词1,在option(逻辑操作栏〕中选择"or"逻辑运算符,在term
2中键入关键词2,逻辑表达式为:关键词1 or 关键词2。逻辑表达式含义:要求检索出包含关键词1或包含关键词2的所有文献。
例如:interferon or interleukin即检索出有关干扰素或白介素的所有专利文献。
逻辑检索运算符and not的使用
term 1中键入关键词1,在option(逻辑操作栏〕中选择"and not"逻辑运算符,在term
2中键入关键词2,逻辑表达式为:关键词1 and not 关键词2。逻辑表达式含义:检索出只包含关键词1而不包含关键词2的专利文献。例如在term
1中键入关键词interferon and not purification即检索出有关于干扰素非纯化方面的所有专利文献。
逻辑检索运算符xor的使用
在term 1中键入关键词1,在option(逻辑操作栏)中选择"xor"逻辑运算符,在term2中键入关键词2,逻辑表达式为:关键词1
xor 关键词2,逻辑表达式含义:要求检索出含有关键词1或关键词2的专利文献,但不包括同时有关键词1和关键词2两个词的的专利文献。例如:interferon
xor interleukin即检索出有关干扰素和白介素的所有专利文献,但不包括同时含有这两个词的专利文献。
·词组检索
本数据库支持词组或短语检索方法,即直接在term栏中键入词组检索。如键入:interferon purification,系统将近回含有该词组的文献。
·字段检索
在field栏中包含有20多个可供检索的字段,可利用检索字段对检索词进行限定检索。常用检索字段应用举例。
发明人检索
例如:要查找发明人名为Simpson的专利文献,可先将Simpson一词输入到term1栏中,在field1选择"Inventor
Name"(发明人名),按动"Submit Query"按钮,系统将在专利文献的发明人字段中查找含有Simpson一词的文献。
专利号检索
例如:要查找专利号为5387139的专利文献,可先将5387139输入到term1中,在field1中选择"patent
number"(专利号),在帮助文档中的database status中查出5387139所在的数据库文档,按动"Submit
Query"按钮,系统将在该文档所收录专利文献的专利号字段中查找出专利号为5387139的专利文献。
截词检索
本系统支持右截词检索,即在检索词的右侧可以用*代替任何字母,如输入检索词tele*,系统将查找出以tele开头的词如television、telecommunications等的所有专利文献。
高级检索方法(advanced search)
在美国专利文献数据库检索主页上的按钮,调出高级检索界面。
高级检索允许用户在term检索框里直接运用逻辑运算符、字段、词组等方式进行检索。
逻辑检索
直接在检索框里输入检索词和逻辑运算符即可。如:
Interleukin and purification
Purification or (Interferon and Interleukin)
逻辑组配的含义与前面所述的相同。
字段检索
在Advanced检索页面的下端列出了所有检索字段的名称缩写,见下表:
 |
检索表达式为:字段缩写/检索词。例如:用Inventor字段查找Dobbs可写成IN/Dobbs。用分类号检索可采用分类字段缩写/分类/子分类的书写方式。如查找270/31类,可写成OCL/270/31,系统将近回所有270/31类下的文献题录。
字段与逻辑运算相结合检索
如:AN/MCNC and TTL/solder,即在查找代理机构为MCNC的并且在题目中含有solder 一词的所有专利文献。
词组检索
用词组检索时,应将该词组用双引号引起,如:
"interferon purification" AN/"General Motors"
如检索表达式:AN/"general mot*"or AN/Ford or an/Chrysler。系统将在专利代理字段中检索以general
mot开头的所有机构的文献以及代理字段为Ford或Chrysler的所有文献。
对返回结果的要求及截词检索
与逻辑检索方法中所述相同。
第三章 网络临床医学信息资源
如前所说Internet上存在着大量的生物科学和医学信息资源,包括生物学期刊杂志、生物信息学和分子生物学信息,同时还包括大量的临床医学信息资源。
随着网络技术的发展,特别是图形界面网络浏览工具的开发,医学可以寻全球范围的医学数据库、病理切片图像、放射影像及多媒体数据库进行检索,在显示图像的同时,还可同时传送语音信息。本章以一个综合性临床医学信息资源数据库服务器--Medical
Matrix,对网络临床医学信息资源作一概括性的介绍。
Medocal Matrix,是一个Internet临床医学信息资源数据库,它收集了分布在全球的Internet临床医学信息资源,分层进行组织,并向用户提供综合查询服务。该数据库收集的信息资源能够以联机文本方式提供,也能够以超文本超链接数据库方式提供(可通过WWW浏览器如Netscape访问)。医生可以将这个数据库设置为自己与Internet相连的桌上计算机的"homepage"(启动计算机的浏览器时出现的主页信息)。
Medical Matrix将网络临床医学信息资源主要分为以下几类:
l 可通过E-Mail获取的临床医学信息资源
有大量的Internet信息可以通过电子邮件获取,而不必使用其它Internet工具。Internet的电子邮件用户一定对Medical
Matrix数据库所提供的下列资源感兴趣:
Mailing lists 医学电子邮件通信组。
FTP by E-mail 通过电子邮件进行的医学文献的传输。
Gopher E-mail 通过电子邮件使用医学Gopher节点浏览信息。
Electronic journals 通过电子邮件订阅的医学电子期刊。
由Internet用户所组成的各种医学讨论组是一类重要的医学信息资源。在这些讨论组里,人们就某一医学问题或疾病的治疗展开讨论,交流新闻,发布新产品信息和会议通知,这些信息的传递速度要比印刷媒体快得多。讨论组中关于计算机和医学、学术研究和信息技术方面的交流量最为频繁。
电子邮件通信组的成员之间可以交流信息,每条信息都直接以电子邮件的形式送到用户的信箱中去,如果要参加一个Medical
Matrix提供的电子邮件通信组,首先应向通信组的注册地址发送一封注册通信组的电子邮件。注册成功之后,通信组的电子邮件服务器会自动向你转发其它组员的电子邮件。
l 医学新闻组资源---Usenet Newsgroup
Medical Matrix 数据库中一共收集有200多个医学"Usenet newsgroup"
,即新闻组或电子公告板,它们提价多种信息服务,是一类重要的信息资源系统,有适当浏览器的用户在临床医学资源数据库Medical
Matrix的入口就可以自动启动新闻阅读器,阅读新闻。Usenet是一个有组织的新闻系统,与传统的通讯、电子邮件通信组和科学团体有很多的共同点。Usenet发展得已经完善,终端用户只需要知道如何使用自己计算机上的新闻阅读软件就可以了。Usenet能将关于某一话题的文章组织起来形成一个"文章链",能将用户发表的文章分配到不同层次的新闻组里去,能够对那些过期的文章进行删除。
此外,Delgrasso博士专门建立了一个"Black Bag Medical BBS List",任何时候都可以发一封电子邮件到list@blackbag,com进行检索。这个地址有400多个有关医学、科学、Fire/EMS心理学、康复、AIDS和残疾的电子公告板系统。
l 联机服务资源
有一些大的信息服务公司能够为用户提供联机的医学信息服务,这些服务有些是收费的。但大多数是免费服务。如CompuServe公司就提供下面这些联机服务:
AMIM医学论坛AMIA Medical Forum
商业数据库加Business Database Plus
癌症论坛 Cancer Forum
CCML AIDS 文章 CCML AIDS Articles
健康论坛 Health Database Plus
健康网 Health Net
健康数据库加 Health & Fitness Forum
IQuest医学信息中心 Quest Medical InfoCenterl
罕见病数据库 NORD Services/Rare disease Database
资料查询 PaperChase(MEDLINE)
医生数据查询 Physicians Data Query
心理学文摘 PsycINFO-Psychological Abstracts
卫生职业 Health Professions
CIS:医学 CIS:MEDICAL
糖尿病论坛 Diabetes Forum
l Web和多媒体信息资源
临床医学Web资源极其丰富,而且使用起来较其它方式更方便。在Infoseek 和Yahoo等Web搜索引擎的网络资源分类表中,Health
and Medicine通常分作一大类;同时在"生物科学"类中也有大量的医学资源网点。世界上每出现一个重要的新的医学问题,都可以在电视台进行相关新闻报道的同时在网络上找到相应的Web网点,例如英国的"疯牛病"和日本的"0157"就是这样。直到现在,人们还可以访问这两种病的Web网点。
一些常见的疾病,如肿瘤、心血管疾病、结核病等都有专门的Web网点进行介绍,人们通常把那些网上综合性临床医学信息网点称为"虚拟医院"、"虚拟医学中心",而把那些专科性的临床医学信息中心称为"虚拟牙科中心"、"虚拟儿科中心"等。
传统的医学信息供应商,包括一些国际著名的医学期刊,也正在进行试验,研究如何通过多媒体的格式与方法使自己的联机服务吸引用户。现在已经有很多的公司、新闻服务机构和学术性研究机构推出了自己的主页,向用户提供产品,为用户开辟论坛,通过交互式多媒体程序教育公众或提价服务。例如用户在Internet上就可以见到Science和Nature等著名期刊的主页。
Netscape等网络浏览器可以显示从远程节点传来的高分辨率的图像,这是一种最有医学应用潜力的Internet功能。一些医学研究机构已经迅速地将大量图像和其它多媒体信息放在了网上。但是,这要求用户与网络有高带宽的连接,如14400BPS,甚至更高,才能显示病理幻灯,传送心音、X光片和照片,这些其实是现在炒得很热的远程医学的部分内容。
Medical Matrix的访问方式
Medical Matrix数据对网络临床医学信息资源的选择和排序,主要是根据资源对临床关键技术的作用、资源的质量、资源的适用性及资源获取的非限制性。除外特殊情况,所有的资源都是"全文本"形式。在地址http://www.uoeh-u.ac.jp/MML/MMS-e.html有一个文档"Medical
Matrix:What's New",专门向用户提价一些新出现的网络临床医学信息资源。
所有采集到一网络临床医学信息资源都按主题分类,放入数据库"Medical Matrix",用户可以在URL地址http://www.slackinc.com/matrix检索该数据库。这个数据库也在不断更新和更正,为用户提价最快捷的获取 临床医学信息的途径。
通过图标和关键词,Medical Matrix能够很容易地帮助用户定位联机临床医学信息资源。在上面介绍的Internet地址,用户见到的总是最新版本的Medical
Matrix组织结构文本格式的Medical Matrix数据库--"The Medical List",现在已经改名为"Medical
Matrix-Internet Clinical Medicine Resource Guide",即"医源--Internet临床医学资源指南",目的是要强调这些资源主要是应用于临床实践。Medical
Matrix数据库所提价的信息资源大致可以分为临床医学信息资源和临床医学相关信息资源两大类。
Medical Matrix的使用步骤及实例
Medical Matrix数据库的使用与其它Internet信息检索工具的使用基本相同,与Yahoo的使用也非常相近,有分类检索和关键词检索两种检索方法。总的来讲,Medical
Matrix的使用可以分为以下四个步骤:
第一步,启动Netscape浏览器后,在Location的一栏内键入Medical Matrix的URL地址,
http:\\www.medmatrix.org/,就会得到Medical Matrix数据库的主页。
如果进行关键词的检索,在对话框中键入即可检出相应的节点。
第二步,如果分类检索,按下滚动条,就可见到Medical Matrix的临床医学信息资源分类表
第三步,选择上图中的Diseases中的Cardiovascular后,就会得到关于这一学科的二级分类
 |
第四步,选择子类中的Coronary Artery Disease,就得到有关该方面的进一步信息及简介。
Medical Matrix数据库收录的新资源
1995年9月以后增加到Medical Matrix数据库中的节点可以在检索工具"What's New
Sever"处检索到。资源的增长速度非同寻常,但其中最重要的是加入了一些商业性新闻服务机构如Reuters,Doctor's
Guide,Newspage,能提供每一天的医学研究进展情况和新的治疗方法,此外还有Clineweb,http://www.ohsu.edu/cliniweb/,能够提供一个检索工具,使用户可以检索按MESH分类的4,000多篇Internet医学文献。Internet为传递声音、图像、视频信息提供了一个非常好的平台。Internet上已经出现了一些短的录像片展示某个病理现象,或图像专家提供对比资料。这提示,如果有高带宽的保证,视频信息的交互有着很大的增长潜力。在http://www.netdoor.com/entinfo/virt01.html,就有一段演示鼻窦解剖结构录像片。
各医学专业的联机电子期刊在网络上都可以得到,从美国医学协会可以检索到高质量的有文摘的文件,从Biomednet也可以得到很多联机医学系列淘汰。还有一些节点为医生提供特别服务,如Medconnect就特别重视高难度临床问题;Medscape则已经成为一个重要医学新闻的首要提供者和著名的医学论坛。
Slack 公司(http://www.slackinc.com/matrix)负责管理这些信息资源的URLs和Medical
Matrix数据库服务器,为全球的用户提供服务。Medical Matrix的"What's New"检索工具(URL:HTTP://www.uoeh-u.ac.jp/MML/MMS-e.html)能向那些新出现在Internet上的医学资源,有关这些新资源的信息在通信组里也可能得到。
Medical Matrix已经被译成为德文、日文、俄文,它的硬拷贝已经以波兰语出版。Slack公司的Cheryl
Capri女士(CCAPRI@slacinc.com)能为您提供更详细的信息和帮助。对于虚拟图书馆、Prodigy和大多数的联机服务来说,Medical
Mateix 是一个高水平的指导者。
|